Ao longo do litoral e no delta do Níger, ocorrem pântanos de água doce e salobra que alguns quilômetros depois dão lugar a florestas tropicais. Nas regiões mais densamente povoadas, a vegetação de florestas foi substituída por palmeiras. No sudoeste, grandes áreas foram desmatadas para o plantio de cacau e seringueiras.
Pontilhada de baobás, tamarindeiros e alfarrobeiras, a savana ocupa a área ao norte da zona florestal. No extremo norte, torna-se mais aberta e apresenta grama curta, com árvores mirradas e esparsas. A região do lago Tchad apresenta condições semidesérticas, com várias espécies de acácia e palmeira africana. Matas ciliares são também comuns na savana aberta da região norte. Nas áreas de maior densidade demográfica, como Sokoto, Kano e Katsina, a intervenção humana -- na forma de queimadas e esgotamento da terra -- resta pouca vegetação. Como resultado, registra-se um avanço gradual do deserto do Saara nos distritos do norte da Nigéria.
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